新疆大学现有乌鲁木齐校区和喀什校区两个校区，乌鲁木齐校区有红湖校园、友好校园、博达校园三个校园。

    两校区占地面积7627.9亩，建筑面积203.7万平方米，其中乌鲁木齐校区4790亩（红湖校园863亩、友好校园218亩、博达校园3709亩），建筑面积133.5万平方米（红湖校园39万平米，友好校园14万平米，博达校园80.5万平米）；喀什校区正在规划建设，校区占地2837.9亩，建筑面积70.2万平方米，总投资42.1亿元。

    各校区统筹布局教学科研楼宇、行政办公用房、实验实训场馆、学生公寓、食堂后勤配套、体育运动场馆等各类校舍建筑；配套建设校园综合管网、供电供暖、道路景观、安防基础设施、校园网络枢纽等全域保障工程。校园建有数字化图书馆、综合体育馆等大型公共文体建筑，校舍硬件体系持续完善，依托新建、修缮改造项目不断优化校园空间布局与基础设施承载能力。